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昆明动物所解析长雄野生稻基因组

生物技术 时间:2019-11-27 09:14:39 作者:莫敖坤
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中科院昆明动物所王文研究组与云南省农科院粮食作物研究所胡凤益研究组等中外机构合作,利用二代测序技术对长雄野生稻进行了大量测序,并通过混合组装技术,成功组装出高质量的长雄野生稻基因组。相关成果日前发表于《分子植物》杂志。

长雄野生稻是非洲的一种野生稻,拥有众多优良性状,如地下茎、自交不亲和以及抗虫、抗病等性状。解析长雄野生稻基因组,将成为更加有效地利用其基因资源的关键一步。然而,长雄野生稻的自交不亲和导致其基因组的高杂合度,为解析工作带来很大挑战。

研究人员对长雄野生稻与近缘物种的分歧时间、基因的收缩扩张等进行了分析。同时,针对长雄野生稻的地下茎以及自交不亲和性状,测序了8个相关组织的转录组并进行了比较转录组学研究。他们还成功鉴定出一批可能影响以上两个性状的候选基因以及代谢途径,为进一步解析地下茎以及自交不亲和分子机制提供了重要线索。(柯讯)

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